Магистерская программа готовит специалистов высокого уровня в области современной теории управления и ее актуальных приложений в технических, организационных, социальных, информационных и биологических системах. Это научное направление, лежащее на стыке математики и информационных технологий, высоко востребовано в различных отраслях реального сектора экономики. Выпускники программы могут построить свою карьеру в научных и образовательных учреждениях, органах власти, государственных и коммерческих компаниях.

Кафедра интегрированных киберсистем МФТИ образована в 2016 году в результате присоединения кафедры технической кибернетики и кафедры информационных бизнес систем к кафедре проблем управления с её последующим переименованием.
Глобальная миссия кафедры является инвариантной — подготовка для научных и образовательных учреждений, органов власти и реального сектора экономики специалистов, обладающих:

• во-первых, фундаментальной подготовкой в области современной теории управления;
• во-вторых, базовыми знаниями в области актуальных приложений теории управления в технических, организационных, социальных и других системах;
• в-третьих, опытом реализации конкретных НИР и ОКР

Всего на кафедре подготовлено более 400 дипломированных специалистов. Около 100 из них сегодня работают в Институте проблем управления РАН. Большинство — доктора и кандидаты наук. Директор ИПУ РАН и два его заместителя по научной работе — выпускники кафедры. Три выпускника кафедры стали членами Российской академии наук. Ежегодно около трети выпускников поступают в аспирантуру. Многие идут дальше — в рамках так называемой программы аспидоков, и в возрасте около 30 лет становятся докторами наук.